根據(jù)上述職責，市商務局設8個內(nèi)設機構：

（一）辦公室

綜合協(xié)調局機關及直屬單位工作，督促重大事項的落實；負責重要會議的組織及會議決定事項和市委、市政府督辦件和人大、政協(xié)建議、提案的督辦與反饋；負責局機關文電、政務信息、機要、保密、信訪、檔案、接待、車輛管理和效能建設等工作；承擔政務信息、政府信息公開、辦公自動化和其他行政后勤工作；負責機關及直屬單位機構編制、人事勞動和離退休人員管理工作；負責指導國有糧食購銷企業(yè)離退休人員的管理和服務、勞動工資管理以及系統(tǒng)機構、人員、工資統(tǒng)計工作。

（二）計劃財務科（內(nèi)部審計室）

負責編報全市商務中長期發(fā)展規(guī)劃，制定全市商務年度考核工作指標體系，參與考核全市各單位外經(jīng)貿(mào)工作；負責監(jiān)測分析商務宏觀運行狀況，承擔有關商務統(tǒng)計及信息發(fā)布工作，提供信息咨詢服務；貫徹落實有關外經(jīng)貿(mào)的財稅、金融、外匯、保險、價格等政策，擬訂并組織實施全市促進商務發(fā)展的政策措施；管理商務發(fā)展基金、擔?；?、中小企業(yè)國際市場開拓資金、出口專項貸款、商務獎勵經(jīng)費等各項業(yè)務資金，承擔由市商務局負責安排的各類資金的具體使用和管理工作；協(xié)調財貿(mào)、稅貿(mào)、銀貿(mào)、匯貿(mào)、信貿(mào)等合作。

組織實施國家有關糧食財務、會計管理的政策；負責各種政策性補貼、費用資金的撥付及使用監(jiān)管，配合有關部門落實糧食風險基金管理；指導、監(jiān)督國有糧食企業(yè)的財務管理、會計核算和會計報表、財務分析的編制；負責局機關財務、資產(chǎn)管理、行政經(jīng)費預算編制、會計核算及行政經(jīng)費的收支；執(zhí)行經(jīng)費預決算制度及各項財務制度；負責國有糧食企業(yè)的內(nèi)部審計工作；負責指導糧食系統(tǒng)增收節(jié)支和國有資產(chǎn)管理工作。

（三）流通業(yè)與市場秩序科

負責流通行業(yè)管理、促進等發(fā)展工作，承擔流通業(yè)發(fā)展規(guī)劃擬訂與組織實施、流通行業(yè)統(tǒng)計、行業(yè)標準推行、行業(yè)科技進步工作；負責我市國內(nèi)貿(mào)易的動態(tài)跟蹤和研究分析工作，牽頭研究制定內(nèi)貿(mào)促進政策并監(jiān)督實施；提出深化流通體制改革的政策措施，會同有關部門擬定并組織實施現(xiàn)代物流產(chǎn)業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略和規(guī)劃；負責物流業(yè)發(fā)展調控，整合公共物流信息平臺，提高物流信息化水平；組織推進連鎖經(jīng)營、商業(yè)特許經(jīng)營等現(xiàn)代流通方式的發(fā)展，承擔拍賣、舊貨流通和再生資源流通等特殊流通行業(yè)監(jiān)管工作；負責指導商業(yè)體系建設和商貿(mào)行業(yè)文明建設；負責組織開展商務領域綜合行政執(zhí)法，牽頭協(xié)調打擊侵權和假冒偽劣商品，協(xié)調打破市場壟斷、行業(yè)壟斷和地區(qū)封鎖的相關工作，牽頭規(guī)范零售企業(yè)促銷行為，促進零售商供應商公平交易；協(xié)調管理我市商品貿(mào)易經(jīng)營秩序，負責國際品牌保護，組織協(xié)調與貿(mào)易有關的知識產(chǎn)權保護應對事項，推動建立和完善多雙邊執(zhí)法合作機制；推動商務領域信用建設、信用擔保、商業(yè)擔保工作。

（四）市場體系建設與市場運行科（電子商務發(fā)展科）

負責市場體系建設和城鄉(xiāng)市場發(fā)展促進工作，擬訂引導資金投向市場體系建設的政策措施，組織實施市場體系建設重大投資項目；指導城市商業(yè)網(wǎng)點規(guī)劃制定與實施、大宗產(chǎn)品批發(fā)市場和社區(qū)商業(yè)建設，推進農(nóng)村市場體系建設和改造升級；指導汽車、建材、農(nóng)機等工業(yè)品流通服務體系建設，承擔汽車流通行業(yè)監(jiān)督管理、報廢汽車監(jiān)督管理和老舊汽車更新工作。

負責商品市場運行調控和商務領域消費促進工作；擬訂并組織實施商品市場運行調節(jié)的政策；負責市場運行、商品供求的監(jiān)測預警和信息引導；負責建立健全生活必需品市場供應應急管理機制；負責組織實施重要消費品市場調控和重要生產(chǎn)資料流通管理，組織實施重要商品（肉、糖、蛋、菜等）市場調控、儲備管理和應急商品調控；負責協(xié)調副食品生產(chǎn)供應工作，指導管理u201c菜籃子u201d商品流通和城市副食品基地建設；按有關規(guī)定監(jiān)督管理酒類流通、原油和成品油流通；統(tǒng)籌商務領域消費促進工作。

制訂全市電子商務開拓市場規(guī)劃、商務領域信息化建設規(guī)劃，擬訂并組織實施扶持電子商務發(fā)展的政策措施和電子商務的相關標準、規(guī)范，建立適應電子商務快速發(fā)展的管理體制，完善跨部門電子商務工作協(xié)作機制，建立電子商務公共服務體系和信用體系，開展電子商務統(tǒng)計監(jiān)測和分析；拓展電子商務應用，重點推進網(wǎng)絡零售、跨境貿(mào)易和生活服務領域電子貿(mào)易；負責電子商務示范體系建設，負責推動電子商務平臺、產(chǎn)業(yè)園區(qū)、示范企業(yè)、基地和城市建設；指導商務領域電子政務工作，組織商務領域信息化的培訓與交流。

（五）對外貿(mào)易和對外經(jīng)濟合作科

指導和管理全市對外貿(mào)易工作，參與擬訂全市外貿(mào)中長期發(fā)展規(guī)劃和年度計劃；承擔全市涉及世貿(mào)組織事務的綜合協(xié)調、指導和服務工作；承擔協(xié)調我市有關進出口公平貿(mào)易的具體工作，建立進出口公平貿(mào)易預警機制；依法負責國際貿(mào)易摩擦應對，指導、協(xié)調外國對我市出口商品的反傾銷、反補貼、保障措施和特殊保障措施的應訴及相關工作；負責我市舉辦或參與的境內(nèi)外國際性展覽會等貿(mào)易促進有關工作，組織實施我市出口品牌體系建設，協(xié)調指導企業(yè)開拓國際市場；負責管理全市加工貿(mào)易，研究擬訂全市對外加工裝配發(fā)展規(guī)劃和年度計劃；負責市直單位對外加工裝配合同的審批；指導協(xié)調管理全市對外加工裝配業(yè)務；負責管理全市服務貿(mào)易，擬訂全市服務貿(mào)易發(fā)展規(guī)劃與年度計劃，推動服務外包發(fā)展和平臺建設；負責全市技術進出口管理工作；協(xié)調全市對臺小額貿(mào)易管理；指導重點商品出口基地建設；協(xié)調管理全市商品進出口經(jīng)營秩序；聯(lián)系、協(xié)調外貿(mào)有關行業(yè)協(xié)會、商會工作；管理外地在本市設立的商務辦事機構。負責全市對外經(jīng)濟合作工作；參與我市對外投資業(yè)務及對外投資統(tǒng)計分析工作；負責管理全市對外勞務合作、對外承包工程工作；協(xié)調管理境外投資企業(yè)；協(xié)調對臺港澳經(jīng)貿(mào)工作；協(xié)調管理全市接受國際多雙邊援助工作和對外經(jīng)濟援助項目的實施工作；依法承擔對外勞務合作、境外就業(yè)、對外承包工程和對外援助的權益保護和監(jiān)督管理工作，服務和管理我市對外勞務派出機構，參與協(xié)調處理有關境外勞務、就業(yè)的突發(fā)事件。

（六）投資促進管理科

指導和管理全市招商引資和投資促進工作；參與擬訂全市吸收外商投資的中長期發(fā)展規(guī)劃和年度計劃，貫徹執(zhí)行《外商投資產(chǎn)業(yè)指導目錄》；負責外資管理相關工作，協(xié)調解決有關問題；配合有關部門組織全市外商投資企業(yè)的聯(lián)合年報工作，負責編制并組織實施全市招商引資方案，組織承辦全市性重大招商活動；對重大招商項目進行跟蹤和促進；負責外資統(tǒng)計工作；協(xié)調指導全市外商投資的咨詢服務工作；負責指導管理全市對臺港澳投資促進工作，協(xié)調處理有關重大問題；指導開發(fā)區(qū)招商引資工作，監(jiān)測分析開發(fā)區(qū)運行情況，負責開發(fā)區(qū)有關統(tǒng)計工作；與境外國際投資機構、商協(xié)會建立投資促進合作關系。承擔市外資領導小組日常工作。

（七）糧食科

研究提出全市糧食宏觀調控、總量平衡和糧食流通中長期規(guī)劃以及動用我市地方儲備糧的建議；負責制訂和組織實施全市糧食倉儲設施建設和改造的規(guī)劃；研究提出我市地方儲備糧的規(guī)模、布局、品種結構的建議；負責糧食倉庫、流通設施建設和改造資金的籌措及使用管理；編制和組織實施儲備糧年度輪換計劃；組織實施福建省糧食流通統(tǒng)計制度；負責糧食流通統(tǒng)計和糧油供需平衡調查工作；負責全市地方儲備糧油的倉儲管理工作；負責應急時期糧油市場調控。

制定全市糧油市場管理制度；負責糧食收購資格審核及骨干糧店、加工企業(yè)管理工作；組織糧食收購，落實惠農(nóng)政策；指導國有糧食企業(yè)改革和經(jīng)營管理工作；落實糧食產(chǎn)銷協(xié)作工作；承擔軍糧供應保障工作；負責糧食市場監(jiān)測預警；擬訂糧食安全應急預警預案并組織實施；協(xié)調救災救濟和重要節(jié)日的糧食供應；核定本行政區(qū)域內(nèi)糧食批發(fā)、加工企業(yè)、連鎖超市等糧食經(jīng)營企業(yè)正常情況下的最低庫存及異常情況下最高庫存；承擔市人民政府糧食安全應急指揮部日常工作；負責糧食行業(yè)科技管理、新技術應用；指導糧油品牌建設、龍頭企業(yè)建設及糧食種植基地建設；負責對糧食收購環(huán)節(jié)的糧食質量安全和原糧衛(wèi)生進行監(jiān)管。依法對糧食經(jīng)營者從事糧食收購、儲存、運輸活動和政策性用糧的購銷活動及執(zhí)行國家糧食流通統(tǒng)計制度的情況進行監(jiān)督檢查；依法對市儲備糧的數(shù)量、質量、儲存安全以及輪換計劃執(zhí)行情況及儲備糧承儲企業(yè)的資格進行監(jiān)督檢查；負責糧食收購資格、骨干糧食加工企業(yè)及骨干糧店資格的核準；開展糧食流通監(jiān)督檢查工作；指導糧食行業(yè)法制建設，聯(lián)系、協(xié)調市糧油行業(yè)協(xié)會。

（八）政策法規(guī)科（行政審核審批科）

擬訂我市商務發(fā)展戰(zhàn)略、中長期規(guī)劃和推進商務體制改革的措施，研究商務運行和結構調整中的重大問題并提出相關政策建議；起草并組織實施我市有關經(jīng)濟貿(mào)易發(fā)展的規(guī)范性文件。貫徹上級關于流通行業(yè)管理、市場秩序、電子商務、利用外資、對外貿(mào)易和對外經(jīng)濟技術合作的法律法規(guī)和政策規(guī)定；負責本局規(guī)范性文件合法性審核；承擔商務領域法律法規(guī)宣傳工作；負責辦理行政復議、行政訴訟、應訴和行政賠償案件及機關普法、依法行政等工作；配合有關部門參與重大經(jīng)貿(mào)協(xié)議、合同、章程和重大爭議案件的研究與協(xié)調；負責組織重要課題調研工作；負責綜合性材料和政策性文件的起草工作；負責對全市商務領域的安全生產(chǎn)檢查、督促，組織檢查全市糧油實物庫存和儲糧安全工作。負責行政審批事項的審核、核準、審批、備案、轉報及相關政策咨詢工作；負責駐行政服務中心窗口管理和建設工作，以及行政審批制度改革工作和制定行政審批管理工作制度。

機關黨組織根據(jù)《中國共產(chǎn)黨章程》、《中國共產(chǎn)黨和國家機關基層組織工作條例》的有關規(guī)定設置。